La Fondation France Sclérose en Plaques, poursuit 2 objectifs :
1/ Promouvoir et encourager la recherche française et internationale sur la sclérose en plaques par le financement annuel de projets de recherche dans les différents domaines de la recherche sur la SEP (génétique, imagerie, immunologie, neurobiologie, recherche clinique et virologie) et par le financement exceptionnel de projets de grande envergure.
2/ Diffuser l'information la plus pertinente sur les avancées médicales, scientifiques et thérapeutiques auprès du grand public ("Lettre de la Fondation France SEP", mise à disposition de documentation, informations médicales et scientifiques régulièrement mises à jour sur le site, congrès annuel destiné aux patients...) et auprès de la communauté scientifique et médicale (congrès scientifique annuel européen destiné aux chercheurs français et étrangers, organisation de réunions scientifiques spécialisées,participation aux congrès scientifiques mondiaux).